Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6I8

PXMP4, Peroxisomal membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP4Q9Y6I8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PXMP4Q9Y6I8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PXMP4Q9Y6I8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PXMP4Q9Y6I8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXMP4Q9Y6I8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PXMP4Q9Y6I8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXMP4Q9Y6I8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PXMP4Q9Y6I8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXMP4Q9Y6I8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXMP4Q9Y6I8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms