Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AP4B1Q9Y6B7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP4B1Q9Y6B7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP4B1Q9Y6B7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP4B1Q9Y6B7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP4B1Q9Y6B7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AP4B1Q9Y6B7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP4B1Q9Y6B7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AP4B1Q9Y6B7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP4B1Q9Y6B7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP4B1Q9Y6B7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP4B1Q9Y6B7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
AP4B1Q9Y6B7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP4B1Q9Y6B7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms