Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AUP1Q9Y679 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AUP1Q9Y679 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AUP1Q9Y679 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AUP1Q9Y679 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AUP1Q9Y679 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AUP1Q9Y679 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AUP1Q9Y679 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AUP1Q9Y679 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AUP1Q9Y679 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AUP1Q9Y679 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AUP1Q9Y679 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms