Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX5Q9Y5X3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX5Q9Y5X3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX5Q9Y5X3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX5Q9Y5X3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX5Q9Y5X3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX5Q9Y5X3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX5Q9Y5X3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX5Q9Y5X3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX5Q9Y5X3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX5Q9Y5X3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX5Q9Y5X3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX5Q9Y5X3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX5Q9Y5X3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX5Q9Y5X3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX5Q9Y5X3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX5Q9Y5X3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX5Q9Y5X3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX5Q9Y5X3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX5Q9Y5X3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX5Q9Y5X3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX5Q9Y5X3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX5Q9Y5X3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX5Q9Y5X3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX5Q9Y5X3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX5Q9Y5X3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX5Q9Y5X3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms