Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAI2Q9Y5P3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAI2Q9Y5P3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAI2Q9Y5P3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAI2Q9Y5P3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAI2Q9Y5P3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAI2Q9Y5P3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAI2Q9Y5P3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAI2Q9Y5P3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RAI2Q9Y5P3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAI2Q9Y5P3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAI2Q9Y5P3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAI2Q9Y5P3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAI2Q9Y5P3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAI2Q9Y5P3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAI2Q9Y5P3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAI2Q9Y5P3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAI2Q9Y5P3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAI2Q9Y5P3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAI2Q9Y5P3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RAI2Q9Y5P3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAI2Q9Y5P3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAI2Q9Y5P3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms