Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FARP1Q9Y4F1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FARP1Q9Y4F1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FARP1Q9Y4F1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FARP1Q9Y4F1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FARP1Q9Y4F1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FARP1Q9Y4F1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FARP1Q9Y4F1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FARP1Q9Y4F1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FARP1Q9Y4F1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FARP1Q9Y4F1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FARP1Q9Y4F1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FARP1Q9Y4F1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FARP1Q9Y4F1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FARP1Q9Y4F1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FARP1Q9Y4F1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FARP1Q9Y4F1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FARP1Q9Y4F1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FARP1Q9Y4F1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FARP1Q9Y4F1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FARP1Q9Y4F1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FARP1Q9Y4F1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FARP1Q9Y4F1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FARP1Q9Y4F1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FARP1Q9Y4F1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FARP1Q9Y4F1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP1Q9Y4F1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms