Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D0

FAM96B, Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM96BQ9Y3D0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM96BQ9Y3D0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM96BQ9Y3D0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM96BQ9Y3D0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM96BQ9Y3D0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM96BQ9Y3D0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM96BQ9Y3D0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM96BQ9Y3D0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM96BQ9Y3D0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM96BQ9Y3D0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM96BQ9Y3D0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM96BQ9Y3D0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms