Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT52Q9Y366 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT52Q9Y366 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT52Q9Y366 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT52Q9Y366 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT52Q9Y366 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT52Q9Y366 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT52Q9Y366 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT52Q9Y366 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT52Q9Y366 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT52Q9Y366 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT52Q9Y366 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT52Q9Y366 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT52Q9Y366 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT52Q9Y366 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT52Q9Y366 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT52Q9Y366 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT52Q9Y366 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT52Q9Y366 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT52Q9Y366 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT52Q9Y366 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT52Q9Y366 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT52Q9Y366 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT52Q9Y366 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms