Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3M1Q9Y2T2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3M1Q9Y2T2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3M1Q9Y2T2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M1Q9Y2T2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3M1Q9Y2T2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3M1Q9Y2T2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP3M1Q9Y2T2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3M1Q9Y2T2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3M1Q9Y2T2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3M1Q9Y2T2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3M1Q9Y2T2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3M1Q9Y2T2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3M1Q9Y2T2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AP3M1Q9Y2T2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3M1Q9Y2T2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3M1Q9Y2T2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3M1Q9Y2T2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3M1Q9Y2T2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3M1Q9Y2T2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3M1Q9Y2T2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3M1Q9Y2T2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M1Q9Y2T2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M1Q9Y2T2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M1Q9Y2T2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M1Q9Y2T2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3M1Q9Y2T2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M1Q9Y2T2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M1Q9Y2T2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3M1Q9Y2T2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3M1Q9Y2T2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3M1Q9Y2T2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M1Q9Y2T2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3M1Q9Y2T2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3M1Q9Y2T2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3M1Q9Y2T2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms