Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BTRCQ9Y297 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BTRCQ9Y297 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BTRCQ9Y297 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BTRCQ9Y297 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BTRCQ9Y297 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BTRCQ9Y297 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BTRCQ9Y297 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BTRCQ9Y297 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BTRCQ9Y297 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BTRCQ9Y297 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BTRCQ9Y297 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BTRCQ9Y297 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BTRCQ9Y297 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BTRCQ9Y297 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
BTRCQ9Y297 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BTRCQ9Y297 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BTRCQ9Y297 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BTRCQ9Y297 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BTRCQ9Y297 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BTRCQ9Y297 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BTRCQ9Y297 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BTRCQ9Y297 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BTRCQ9Y297 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BTRCQ9Y297 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BTRCQ9Y297 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BTRCQ9Y297 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BTRCQ9Y297 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BTRCQ9Y297 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms