Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC3Q9Y282 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC3Q9Y282 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC3Q9Y282 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC3Q9Y282 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERGIC3Q9Y282 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERGIC3Q9Y282 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERGIC3Q9Y282 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERGIC3Q9Y282 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERGIC3Q9Y282 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERGIC3Q9Y282 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERGIC3Q9Y282 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERGIC3Q9Y282 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERGIC3Q9Y282 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERGIC3Q9Y282 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERGIC3Q9Y282 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERGIC3Q9Y282 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERGIC3Q9Y282 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms