Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHKBQ9Y259 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHKBQ9Y259 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHKBQ9Y259 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHKBQ9Y259 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHKBQ9Y259 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHKBQ9Y259 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHKBQ9Y259 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHKBQ9Y259 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHKBQ9Y259 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHKBQ9Y259 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHKBQ9Y259 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHKBQ9Y259 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHKBQ9Y259 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHKBQ9Y259 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHKBQ9Y259 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHKBQ9Y259 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHKBQ9Y259 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHKBQ9Y259 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHKBQ9Y259 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHKBQ9Y259 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHKBQ9Y259 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHKBQ9Y259 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHKBQ9Y259 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHKBQ9Y259 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHKBQ9Y259 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHKBQ9Y259 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHKBQ9Y259 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHKBQ9Y259 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHKBQ9Y259 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms