Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ2

Psmd13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd13Q9WVJ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmd13Q9WVJ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmd13Q9WVJ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd13Q9WVJ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd13Q9WVJ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psmd13Q9WVJ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmd13Q9WVJ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmd13Q9WVJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmd13Q9WVJ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmd13Q9WVJ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmd13Q9WVJ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmd13Q9WVJ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmd13Q9WVJ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmd13Q9WVJ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmd13Q9WVJ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psmd13Q9WVJ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmd13Q9WVJ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmd13Q9WVJ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmd13Q9WVJ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd13Q9WVJ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd13Q9WVJ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd13Q9WVJ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd13Q9WVJ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd13Q9WVJ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd13Q9WVJ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmd13Q9WVJ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmd13Q9WVJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmd13Q9WVJ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmd13Q9WVJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd13Q9WVJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmd13Q9WVJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psmd13Q9WVJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd13Q9WVJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd13Q9WVJ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd13Q9WVJ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd13Q9WVJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd13Q9WVJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd13Q9WVJ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd13Q9WVJ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd13Q9WVJ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd13Q9WVJ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd13Q9WVJ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd13Q9WVJ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd13Q9WVJ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd13Q9WVJ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd13Q9WVJ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd13Q9WVJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms