Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apobec2Q9WV35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apobec2Q9WV35 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apobec2Q9WV35 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apobec2Q9WV35 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apobec2Q9WV35 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apobec2Q9WV35 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apobec2Q9WV35 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apobec2Q9WV35 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apobec2Q9WV35 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apobec2Q9WV35 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apobec2Q9WV35 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apobec2Q9WV35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apobec2Q9WV35 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apobec2Q9WV35 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apobec2Q9WV35 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Apobec2Q9WV35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apobec2Q9WV35 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apobec2Q9WV35 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apobec2Q9WV35 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apobec2Q9WV35 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Apobec2Q9WV35 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apobec2Q9WV35 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apobec2Q9WV35 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apobec2Q9WV35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apobec2Q9WV35 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apobec2Q9WV35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apobec2Q9WV35 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apobec2Q9WV35 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apobec2Q9WV35 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apobec2Q9WV35 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Apobec2Q9WV35 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec2Q9WV35 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec2Q9WV35 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec2Q9WV35 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apobec2Q9WV35 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apobec2Q9WV35 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Apobec2Q9WV35 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apobec2Q9WV35 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apobec2Q9WV35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apobec2Q9WV35 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apobec2Q9WV35 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Apobec2Q9WV35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apobec2Q9WV35 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apobec2Q9WV35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apobec2Q9WV35 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apobec2Q9WV35 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apobec2Q9WV35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apobec2Q9WV35 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apobec2Q9WV35 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apobec2Q9WV35 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apobec2Q9WV35 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms