Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbck1Q9WUB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbck1Q9WUB0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbck1Q9WUB0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbck1Q9WUB0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbck1Q9WUB0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbck1Q9WUB0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbck1Q9WUB0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbck1Q9WUB0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbck1Q9WUB0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbck1Q9WUB0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbck1Q9WUB0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbck1Q9WUB0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbck1Q9WUB0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbck1Q9WUB0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbck1Q9WUB0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbck1Q9WUB0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbck1Q9WUB0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbck1Q9WUB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbck1Q9WUB0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbck1Q9WUB0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbck1Q9WUB0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbck1Q9WUB0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbck1Q9WUB0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbck1Q9WUB0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbck1Q9WUB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbck1Q9WUB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbck1Q9WUB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbck1Q9WUB0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbck1Q9WUB0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbck1Q9WUB0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbck1Q9WUB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms