Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM33Q9UPN9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM33Q9UPN9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM33Q9UPN9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM33Q9UPN9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM33Q9UPN9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM33Q9UPN9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM33Q9UPN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM33Q9UPN9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM33Q9UPN9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM33Q9UPN9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM33Q9UPN9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM33Q9UPN9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM33Q9UPN9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM33Q9UPN9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM33Q9UPN9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM33Q9UPN9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM33Q9UPN9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM33Q9UPN9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM33Q9UPN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM33Q9UPN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM33Q9UPN9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM33Q9UPN9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM33Q9UPN9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms