Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC4AQ9UMR7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC4AQ9UMR7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC4AQ9UMR7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4AQ9UMR7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC4AQ9UMR7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC4AQ9UMR7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC4AQ9UMR7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC4AQ9UMR7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLEC4AQ9UMR7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLEC4AQ9UMR7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLEC4AQ9UMR7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLEC4AQ9UMR7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC4AQ9UMR7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC4AQ9UMR7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC4AQ9UMR7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC4AQ9UMR7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC4AQ9UMR7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4AQ9UMR7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4AQ9UMR7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC4AQ9UMR7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4AQ9UMR7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms