Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT6Q9ULM6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT6Q9ULM6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT6Q9ULM6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT6Q9ULM6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT6Q9ULM6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT6Q9ULM6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT6Q9ULM6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT6Q9ULM6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT6Q9ULM6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT6Q9ULM6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT6Q9ULM6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT6Q9ULM6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT6Q9ULM6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNOT6Q9ULM6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNOT6Q9ULM6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CNOT6Q9ULM6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT6Q9ULM6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT6Q9ULM6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT6Q9ULM6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT6Q9ULM6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT6Q9ULM6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT6Q9ULM6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT6Q9ULM6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT6Q9ULM6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms