Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRID1Q9ULK0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRID1Q9ULK0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRID1Q9ULK0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRID1Q9ULK0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRID1Q9ULK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRID1Q9ULK0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRID1Q9ULK0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRID1Q9ULK0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRID1Q9ULK0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRID1Q9ULK0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRID1Q9ULK0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRID1Q9ULK0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GRID1Q9ULK0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRID1Q9ULK0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRID1Q9ULK0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRID1Q9ULK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRID1Q9ULK0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRID1Q9ULK0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRID1Q9ULK0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRID1Q9ULK0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRID1Q9ULK0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRID1Q9ULK0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRID1Q9ULK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRID1Q9ULK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRID1Q9ULK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRID1Q9ULK0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRID1Q9ULK0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRID1Q9ULK0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRID1Q9ULK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRID1Q9ULK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRID1Q9ULK0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRID1Q9ULK0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRID1Q9ULK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRID1Q9ULK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GRID1Q9ULK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRID1Q9ULK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms