Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME2Q9UL46 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME2Q9UL46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME2Q9UL46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME2Q9UL46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME2Q9UL46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME2Q9UL46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME2Q9UL46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME2Q9UL46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME2Q9UL46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME2Q9UL46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME2Q9UL46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME2Q9UL46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME2Q9UL46 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSME2Q9UL46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME2Q9UL46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME2Q9UL46 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME2Q9UL46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSME2Q9UL46 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME2Q9UL46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms