Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXL3Q9UKT7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXL3Q9UKT7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXL3Q9UKT7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXL3Q9UKT7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXL3Q9UKT7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXL3Q9UKT7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXL3Q9UKT7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXL3Q9UKT7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXL3Q9UKT7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL3Q9UKT7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXL3Q9UKT7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL3Q9UKT7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXL3Q9UKT7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXL3Q9UKT7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms