Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJD2Q9UKL4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GJD2Q9UKL4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJD2Q9UKL4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJD2Q9UKL4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJD2Q9UKL4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJD2Q9UKL4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJD2Q9UKL4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJD2Q9UKL4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJD2Q9UKL4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJD2Q9UKL4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
GJD2Q9UKL4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJD2Q9UKL4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJD2Q9UKL4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJD2Q9UKL4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJD2Q9UKL4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD2Q9UKL4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD2Q9UKL4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD2Q9UKL4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD2Q9UKL4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD2Q9UKL4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJD2Q9UKL4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GJD2Q9UKL4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJD2Q9UKL4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJD2Q9UKL4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GJD2Q9UKL4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GJD2Q9UKL4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJD2Q9UKL4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJD2Q9UKL4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
GJD2Q9UKL4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GJD2Q9UKL4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GJD2Q9UKL4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJD2Q9UKL4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJD2Q9UKL4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJD2Q9UKL4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJD2Q9UKL4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD2Q9UKL4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJD2Q9UKL4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJD2Q9UKL4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD2Q9UKL4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJD2Q9UKL4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJD2Q9UKL4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD2Q9UKL4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD2Q9UKL4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD2Q9UKL4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD2Q9UKL4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJD2Q9UKL4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD2Q9UKL4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD2Q9UKL4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJD2Q9UKL4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJD2Q9UKL4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJD2Q9UKL4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD2Q9UKL4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD2Q9UKL4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD2Q9UKL4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJD2Q9UKL4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJD2Q9UKL4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJD2Q9UKL4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD2Q9UKL4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD2Q9UKL4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GJD2Q9UKL4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GJD2Q9UKL4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GJD2Q9UKL4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD2Q9UKL4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJD2Q9UKL4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms