Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP3Q9UKI2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP3Q9UKI2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP3Q9UKI2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP3Q9UKI2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP3Q9UKI2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP3Q9UKI2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP3Q9UKI2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms