Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GMEB2Q9UKD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms