Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TUBE1Q9UJT0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TUBE1Q9UJT0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TUBE1Q9UJT0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TUBE1Q9UJT0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TUBE1Q9UJT0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TUBE1Q9UJT0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TUBE1Q9UJT0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TUBE1Q9UJT0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TUBE1Q9UJT0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TUBE1Q9UJT0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TUBE1Q9UJT0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TUBE1Q9UJT0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TUBE1Q9UJT0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TUBE1Q9UJT0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TUBE1Q9UJT0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TUBE1Q9UJT0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TUBE1Q9UJT0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TUBE1Q9UJT0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TUBE1Q9UJT0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TUBE1Q9UJT0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TUBE1Q9UJT0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TUBE1Q9UJT0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TUBE1Q9UJT0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TUBE1Q9UJT0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TUBE1Q9UJT0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TUBE1Q9UJT0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TUBE1Q9UJT0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TUBE1Q9UJT0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TUBE1Q9UJT0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TUBE1Q9UJT0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TUBE1Q9UJT0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TUBE1Q9UJT0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms