Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL4Q9UJQ4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL4Q9UJQ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SALL4Q9UJQ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SALL4Q9UJQ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL4Q9UJQ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SALL4Q9UJQ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SALL4Q9UJQ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL4Q9UJQ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SALL4Q9UJQ4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SALL4Q9UJQ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SALL4Q9UJQ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SALL4Q9UJQ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SALL4Q9UJQ4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SALL4Q9UJQ4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SALL4Q9UJQ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL4Q9UJQ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SALL4Q9UJQ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SALL4Q9UJQ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SALL4Q9UJQ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SALL4Q9UJQ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SALL4Q9UJQ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SALL4Q9UJQ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SALL4Q9UJQ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SALL4Q9UJQ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SALL4Q9UJQ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL4Q9UJQ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL4Q9UJQ4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL4Q9UJQ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL4Q9UJQ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL4Q9UJQ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms