Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRLS1Q9UJA2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRLS1Q9UJA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRLS1Q9UJA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRLS1Q9UJA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRLS1Q9UJA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRLS1Q9UJA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRLS1Q9UJA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRLS1Q9UJA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRLS1Q9UJA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRLS1Q9UJA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRLS1Q9UJA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRLS1Q9UJA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRLS1Q9UJA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRLS1Q9UJA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRLS1Q9UJA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRLS1Q9UJA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRLS1Q9UJA2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRLS1Q9UJA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRLS1Q9UJA2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRLS1Q9UJA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRLS1Q9UJA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRLS1Q9UJA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CRLS1Q9UJA2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRLS1Q9UJA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRLS1Q9UJA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRLS1Q9UJA2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRLS1Q9UJA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRLS1Q9UJA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRLS1Q9UJA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRLS1Q9UJA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRLS1Q9UJA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRLS1Q9UJA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRLS1Q9UJA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRLS1Q9UJA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRLS1Q9UJA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms