Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDH22Q9UJ99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDH22Q9UJ99 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDH22Q9UJ99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDH22Q9UJ99 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDH22Q9UJ99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDH22Q9UJ99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDH22Q9UJ99 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDH22Q9UJ99 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CDH22Q9UJ99 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDH22Q9UJ99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CDH22Q9UJ99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDH22Q9UJ99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDH22Q9UJ99 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDH22Q9UJ99 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDH22Q9UJ99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDH22Q9UJ99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDH22Q9UJ99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDH22Q9UJ99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDH22Q9UJ99 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDH22Q9UJ99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDH22Q9UJ99 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDH22Q9UJ99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDH22Q9UJ99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDH22Q9UJ99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDH22Q9UJ99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDH22Q9UJ99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDH22Q9UJ99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDH22Q9UJ99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDH22Q9UJ99 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDH22Q9UJ99 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDH22Q9UJ99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms