Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TBK1Q9UHD2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TBK1Q9UHD2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TBK1Q9UHD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TBK1Q9UHD2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TBK1Q9UHD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TBK1Q9UHD2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TBK1Q9UHD2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBK1Q9UHD2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBK1Q9UHD2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBK1Q9UHD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBK1Q9UHD2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBK1Q9UHD2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBK1Q9UHD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TBK1Q9UHD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TBK1Q9UHD2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TBK1Q9UHD2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TBK1Q9UHD2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TBK1Q9UHD2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TBK1Q9UHD2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TBK1Q9UHD2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TBK1Q9UHD2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TBK1Q9UHD2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TBK1Q9UHD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TBK1Q9UHD2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TBK1Q9UHD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TBK1Q9UHD2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TBK1Q9UHD2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TBK1Q9UHD2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TBK1Q9UHD2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TBK1Q9UHD2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms