Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3KQ9UBQ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3KQ9UBQ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3KQ9UBQ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3KQ9UBQ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3KQ9UBQ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3KQ9UBQ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3KQ9UBQ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3KQ9UBQ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3KQ9UBQ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3KQ9UBQ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3KQ9UBQ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3KQ9UBQ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms