Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DKK3Q9UBP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DKK3Q9UBP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DKK3Q9UBP4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DKK3Q9UBP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DKK3Q9UBP4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DKK3Q9UBP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DKK3Q9UBP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DKK3Q9UBP4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DKK3Q9UBP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DKK3Q9UBP4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DKK3Q9UBP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DKK3Q9UBP4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DKK3Q9UBP4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DKK3Q9UBP4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DKK3Q9UBP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DKK3Q9UBP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms