Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HDAC6Q9UBN7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HDAC6Q9UBN7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HDAC6Q9UBN7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HDAC6Q9UBN7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HDAC6Q9UBN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HDAC6Q9UBN7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HDAC6Q9UBN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HDAC6Q9UBN7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HDAC6Q9UBN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HDAC6Q9UBN7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HDAC6Q9UBN7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HDAC6Q9UBN7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HDAC6Q9UBN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDAC6Q9UBN7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDAC6Q9UBN7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDAC6Q9UBN7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDAC6Q9UBN7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDAC6Q9UBN7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDAC6Q9UBN7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDAC6Q9UBN7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDAC6Q9UBN7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDAC6Q9UBN7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDAC6Q9UBN7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
HDAC6Q9UBN7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDAC6Q9UBN7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDAC6Q9UBN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HDAC6Q9UBN7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HDAC6Q9UBN7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HDAC6Q9UBN7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDAC6Q9UBN7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HDAC6Q9UBN7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDAC6Q9UBN7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HDAC6Q9UBN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HDAC6Q9UBN7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HDAC6Q9UBN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HDAC6Q9UBN7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HDAC6Q9UBN7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
HDAC6Q9UBN7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms