Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEMTQ9UBM1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEMTQ9UBM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEMTQ9UBM1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEMTQ9UBM1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEMTQ9UBM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEMTQ9UBM1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEMTQ9UBM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEMTQ9UBM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PEMTQ9UBM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEMTQ9UBM1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEMTQ9UBM1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEMTQ9UBM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms