Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD9

CLCF1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCF1Q9UBD9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCF1Q9UBD9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCF1Q9UBD9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCF1Q9UBD9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCF1Q9UBD9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCF1Q9UBD9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCF1Q9UBD9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCF1Q9UBD9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCF1Q9UBD9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCF1Q9UBD9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCF1Q9UBD9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCF1Q9UBD9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCF1Q9UBD9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCF1Q9UBD9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCF1Q9UBD9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCF1Q9UBD9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCF1Q9UBD9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCF1Q9UBD9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms