Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma4Q9R1P0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma4Q9R1P0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma4Q9R1P0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma4Q9R1P0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma4Q9R1P0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma4Q9R1P0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma4Q9R1P0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma4Q9R1P0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Psma4Q9R1P0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Psma4Q9R1P0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psma4Q9R1P0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psma4Q9R1P0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Psma4Q9R1P0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psma4Q9R1P0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psma4Q9R1P0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psma4Q9R1P0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psma4Q9R1P0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms