Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsjQ9R014 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsjQ9R014 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsjQ9R014 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsjQ9R014 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsjQ9R014 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsjQ9R014 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsjQ9R014 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtsjQ9R014 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsjQ9R014 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsjQ9R014 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsjQ9R014 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtsjQ9R014 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtsjQ9R014 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsjQ9R014 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsjQ9R014 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CtsjQ9R014 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsjQ9R014 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsjQ9R014 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsjQ9R014 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsjQ9R014 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsjQ9R014 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsjQ9R014 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsjQ9R014 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsjQ9R014 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsjQ9R014 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsjQ9R014 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsjQ9R014 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtsjQ9R014 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtsjQ9R014 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtsjQ9R014 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtsjQ9R014 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsjQ9R014 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsjQ9R014 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsjQ9R014 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsjQ9R014 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtsjQ9R014 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsjQ9R014 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms