Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnip3Q9QXT8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnip3Q9QXT8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnip3Q9QXT8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnip3Q9QXT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnip3Q9QXT8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnip3Q9QXT8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnip3Q9QXT8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnip3Q9QXT8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip3Q9QXT8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnip3Q9QXT8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnip3Q9QXT8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnip3Q9QXT8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnip3Q9QXT8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnip3Q9QXT8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip3Q9QXT8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms