Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNTN3Q9P232 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CNTN3Q9P232 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNTN3Q9P232 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTN3Q9P232 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNTN3Q9P232 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTN3Q9P232 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTN3Q9P232 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNTN3Q9P232 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNTN3Q9P232 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTN3Q9P232 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNTN3Q9P232 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNTN3Q9P232 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CNTN3Q9P232 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNTN3Q9P232 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTN3Q9P232 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTN3Q9P232 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTN3Q9P232 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTN3Q9P232 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms