Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHD2Q9NZN4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EHD2Q9NZN4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EHD2Q9NZN4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EHD2Q9NZN4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EHD2Q9NZN4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EHD2Q9NZN4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EHD2Q9NZN4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EHD2Q9NZN4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
EHD2Q9NZN4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EHD2Q9NZN4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EHD2Q9NZN4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EHD2Q9NZN4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EHD2Q9NZN4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHD2Q9NZN4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EHD2Q9NZN4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EHD2Q9NZN4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD2Q9NZN4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHD2Q9NZN4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHD2Q9NZN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EHD2Q9NZN4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
EHD2Q9NZN4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EHD2Q9NZN4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EHD2Q9NZN4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EHD2Q9NZN4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD2Q9NZN4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD2Q9NZN4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EHD2Q9NZN4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EHD2Q9NZN4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EHD2Q9NZN4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EHD2Q9NZN4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHD2Q9NZN4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
EHD2Q9NZN4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EHD2Q9NZN4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHD2Q9NZN4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EHD2Q9NZN4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EHD2Q9NZN4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EHD2Q9NZN4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHD2Q9NZN4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms