Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVK13-1Q9NX77 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK13-1Q9NX77 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK13-1Q9NX77 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK13-1Q9NX77 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK13-1Q9NX77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK13-1Q9NX77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK13-1Q9NX77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK13-1Q9NX77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK13-1Q9NX77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK13-1Q9NX77 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK13-1Q9NX77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK13-1Q9NX77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK13-1Q9NX77 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK13-1Q9NX77 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK13-1Q9NX77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK13-1Q9NX77 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK13-1Q9NX77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK13-1Q9NX77 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK13-1Q9NX77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms