Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM160Q9NX00 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM160Q9NX00 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM160Q9NX00 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM160Q9NX00 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM160Q9NX00 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM160Q9NX00 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM160Q9NX00 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM160Q9NX00 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM160Q9NX00 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM160Q9NX00 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM160Q9NX00 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM160Q9NX00 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM160Q9NX00 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM160Q9NX00 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM160Q9NX00 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM160Q9NX00 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM160Q9NX00 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM160Q9NX00 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM160Q9NX00 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM160Q9NX00 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM160Q9NX00 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM160Q9NX00 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM160Q9NX00 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM160Q9NX00 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM160Q9NX00 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM160Q9NX00 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms