Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GINM1Q9NU53 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GINM1Q9NU53 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GINM1Q9NU53 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GINM1Q9NU53 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GINM1Q9NU53 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GINM1Q9NU53 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GINM1Q9NU53 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GINM1Q9NU53 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GINM1Q9NU53 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GINM1Q9NU53 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GINM1Q9NU53 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GINM1Q9NU53 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GINM1Q9NU53 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GINM1Q9NU53 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GINM1Q9NU53 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GINM1Q9NU53 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GINM1Q9NU53 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GINM1Q9NU53 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GINM1Q9NU53 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GINM1Q9NU53 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GINM1Q9NU53 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GINM1Q9NU53 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
GINM1Q9NU53 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GINM1Q9NU53 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GINM1Q9NU53 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GINM1Q9NU53 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GINM1Q9NU53 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GINM1Q9NU53 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GINM1Q9NU53 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GINM1Q9NU53 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GINM1Q9NU53 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GINM1Q9NU53 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GINM1Q9NU53 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GINM1Q9NU53 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GINM1Q9NU53 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GINM1Q9NU53 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GINM1Q9NU53 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GINM1Q9NU53 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GINM1Q9NU53 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GINM1Q9NU53 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GINM1Q9NU53 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GINM1Q9NU53 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GINM1Q9NU53 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GINM1Q9NU53 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GINM1Q9NU53 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GINM1Q9NU53 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GINM1Q9NU53 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GINM1Q9NU53 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GINM1Q9NU53 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GINM1Q9NU53 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GINM1Q9NU53 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GINM1Q9NU53 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GINM1Q9NU53 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GINM1Q9NU53 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GINM1Q9NU53 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
GINM1Q9NU53 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GINM1Q9NU53 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GINM1Q9NU53 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GINM1Q9NU53 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GINM1Q9NU53 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GINM1Q9NU53 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GINM1Q9NU53 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GINM1Q9NU53 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GINM1Q9NU53 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GINM1Q9NU53 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms