Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP8A2Q9NTI2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP8A2Q9NTI2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP8A2Q9NTI2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP8A2Q9NTI2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP8A2Q9NTI2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP8A2Q9NTI2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP8A2Q9NTI2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP8A2Q9NTI2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP8A2Q9NTI2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP8A2Q9NTI2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ATP8A2Q9NTI2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP8A2Q9NTI2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP8A2Q9NTI2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP8A2Q9NTI2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP8A2Q9NTI2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP8A2Q9NTI2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP8A2Q9NTI2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ATP8A2Q9NTI2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATP8A2Q9NTI2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP8A2Q9NTI2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP8A2Q9NTI2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP8A2Q9NTI2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP8A2Q9NTI2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATP8A2Q9NTI2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATP8A2Q9NTI2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP8A2Q9NTI2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP8A2Q9NTI2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP8A2Q9NTI2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP8A2Q9NTI2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP8A2Q9NTI2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP8A2Q9NTI2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP8A2Q9NTI2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP8A2Q9NTI2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP8A2Q9NTI2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATP8A2Q9NTI2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP8A2Q9NTI2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP8A2Q9NTI2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP8A2Q9NTI2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP8A2Q9NTI2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP8A2Q9NTI2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ATP8A2Q9NTI2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP8A2Q9NTI2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP8A2Q9NTI2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP8A2Q9NTI2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP8A2Q9NTI2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP8A2Q9NTI2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms