Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GKN1Q9NS71 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GKN1Q9NS71 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GKN1Q9NS71 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GKN1Q9NS71 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GKN1Q9NS71 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GKN1Q9NS71 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GKN1Q9NS71 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GKN1Q9NS71 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GKN1Q9NS71 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GKN1Q9NS71 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GKN1Q9NS71 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GKN1Q9NS71 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GKN1Q9NS71 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GKN1Q9NS71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GKN1Q9NS71 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GKN1Q9NS71 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GKN1Q9NS71 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GKN1Q9NS71 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GKN1Q9NS71 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GKN1Q9NS71 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GKN1Q9NS71 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GKN1Q9NS71 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GKN1Q9NS71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GKN1Q9NS71 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GKN1Q9NS71 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GKN1Q9NS71 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GKN1Q9NS71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GKN1Q9NS71 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GKN1Q9NS71 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GKN1Q9NS71 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GKN1Q9NS71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms