Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMC2Q9NRP2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMC2Q9NRP2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMC2Q9NRP2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMC2Q9NRP2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CMC2Q9NRP2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CMC2Q9NRP2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMC2Q9NRP2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMC2Q9NRP2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMC2Q9NRP2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC2Q9NRP2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC2Q9NRP2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC2Q9NRP2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CMC2Q9NRP2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMC2Q9NRP2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMC2Q9NRP2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMC2Q9NRP2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMC2Q9NRP2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMC2Q9NRP2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMC2Q9NRP2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMC2Q9NRP2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CMC2Q9NRP2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMC2Q9NRP2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMC2Q9NRP2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMC2Q9NRP2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMC2Q9NRP2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMC2Q9NRP2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMC2Q9NRP2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMC2Q9NRP2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMC2Q9NRP2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMC2Q9NRP2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMC2Q9NRP2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMC2Q9NRP2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMC2Q9NRP2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMC2Q9NRP2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CMC2Q9NRP2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMC2Q9NRP2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMC2Q9NRP2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms