Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLE4Q9NR33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLE4Q9NR33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLE4Q9NR33 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE4Q9NR33 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLE4Q9NR33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLE4Q9NR33 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLE4Q9NR33 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLE4Q9NR33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLE4Q9NR33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLE4Q9NR33 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLE4Q9NR33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLE4Q9NR33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLE4Q9NR33 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLE4Q9NR33 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms