Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GDF3Q9NR23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GDF3Q9NR23 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GDF3Q9NR23 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GDF3Q9NR23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GDF3Q9NR23 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GDF3Q9NR23 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GDF3Q9NR23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GDF3Q9NR23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF3Q9NR23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF3Q9NR23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF3Q9NR23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GDF3Q9NR23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GDF3Q9NR23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GDF3Q9NR23 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GDF3Q9NR23 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GDF3Q9NR23 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GDF3Q9NR23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GDF3Q9NR23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GDF3Q9NR23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GDF3Q9NR23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GDF3Q9NR23 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GDF3Q9NR23 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GDF3Q9NR23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GDF3Q9NR23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GDF3Q9NR23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDF3Q9NR23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF3Q9NR23 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms