Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM8Q9NQV8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM8Q9NQV8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM8Q9NQV8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM8Q9NQV8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM8Q9NQV8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM8Q9NQV8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM8Q9NQV8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM8Q9NQV8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM8Q9NQV8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM8Q9NQV8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM8Q9NQV8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM8Q9NQV8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM8Q9NQV8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM8Q9NQV8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM8Q9NQV8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM8Q9NQV8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM8Q9NQV8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM8Q9NQV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM8Q9NQV8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM8Q9NQV8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM8Q9NQV8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM8Q9NQV8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM8Q9NQV8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM8Q9NQV8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM8Q9NQV8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM8Q9NQV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM8Q9NQV8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms