Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM10Q9NQV6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM10Q9NQV6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM10Q9NQV6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM10Q9NQV6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM10Q9NQV6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM10Q9NQV6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM10Q9NQV6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM10Q9NQV6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM10Q9NQV6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM10Q9NQV6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM10Q9NQV6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM10Q9NQV6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM10Q9NQV6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM10Q9NQV6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM10Q9NQV6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM10Q9NQV6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM10Q9NQV6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM10Q9NQV6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRDM10Q9NQV6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRDM10Q9NQV6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM10Q9NQV6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM10Q9NQV6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM10Q9NQV6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM10Q9NQV6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM10Q9NQV6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRDM10Q9NQV6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM10Q9NQV6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRDM10Q9NQV6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM10Q9NQV6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM10Q9NQV6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PRDM10Q9NQV6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM10Q9NQV6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM10Q9NQV6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM10Q9NQV6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRDM10Q9NQV6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM10Q9NQV6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PRDM10Q9NQV6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRDM10Q9NQV6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PRDM10Q9NQV6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRDM10Q9NQV6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRDM10Q9NQV6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM10Q9NQV6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM10Q9NQV6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM10Q9NQV6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM10Q9NQV6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM10Q9NQV6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM10Q9NQV6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM10Q9NQV6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM10Q9NQV6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM10Q9NQV6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM10Q9NQV6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM10Q9NQV6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM10Q9NQV6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM10Q9NQV6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM10Q9NQV6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM10Q9NQV6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM10Q9NQV6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM10Q9NQV6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM10Q9NQV6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM10Q9NQV6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM10Q9NQV6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM10Q9NQV6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRDM10Q9NQV6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM10Q9NQV6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM10Q9NQV6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms