Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FSCN3Q9NQT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FSCN3Q9NQT6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FSCN3Q9NQT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FSCN3Q9NQT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FSCN3Q9NQT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FSCN3Q9NQT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FSCN3Q9NQT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FSCN3Q9NQT6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FSCN3Q9NQT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FSCN3Q9NQT6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FSCN3Q9NQT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FSCN3Q9NQT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FSCN3Q9NQT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FSCN3Q9NQT6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FSCN3Q9NQT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN3Q9NQT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSCN3Q9NQT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSCN3Q9NQT6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSCN3Q9NQT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN3Q9NQT6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN3Q9NQT6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSCN3Q9NQT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSCN3Q9NQT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms